Достоверной информации о происхождении драконов в мире Мартина нет ни в книгах, ни в сериале. Однако всё указывает на их взаимосвязь с магией (т.е. это не простые животные). Следовательно, и драконье пламя скорее всего имеет магическую природу.

Белый ходок получается от того, что дитя леса всаживает связанному человеку обсидиановый нож в сердце. Если теперь белого ходока приложить тем же обсидианом или (не совсем понятно, чем) особенной валирийской сталью, он рассыпется в ледяную пыль (в книгах, кстати, погибают они иначе, но нисколько не лучше). Никакой физиологией тут не пахнет, это хитрая магия (по беспределу, безо всяких сколько-нибудь стилизованных под разумные оснований). Это я к тому, что, по-моему, вопрос о физиологии драконов лишён смысла: вот дракон, а вот из него пламя, остальное неважно для повествования и любые попытки рационального объяснения этого бесперспективны.

Значит можно считать, что огонь драконов имеет магическое происхождение. Если уже маленький дракон имеет такой большой запас пламени, то накоплением в его организме водорода это никак нельзя объяснить.